Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg6P61406 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smg6P61406 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg6P61406 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg6P61406 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg6P61406 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg6P61406 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg6P61406 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg6P61406 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smg6P61406 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.2 ms