Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme3P61290 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme3P61290 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme3P61290 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psme3P61290 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psme3P61290 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Psme3P61290 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Psme3P61290 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psme3P61290 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms