Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CirbpP60824 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CirbpP60824 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CirbpP60824 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CirbpP60824 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CirbpP60824 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CirbpP60824 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms