Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rims4P60191 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rims4P60191 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rims4P60191 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms