Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CgnP59242 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CgnP59242 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CgnP59242 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CgnP59242 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CgnP59242 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CgnP59242 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CgnP59242 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CgnP59242 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CgnP59242 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CgnP59242 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CgnP59242 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CgnP59242 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CgnP59242 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CgnP59242 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CgnP59242 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CgnP59242 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CgnP59242 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CgnP59242 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CgnP59242 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CgnP59242 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CgnP59242 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CgnP59242 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CgnP59242 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CgnP59242 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CgnP59242 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CgnP59242 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CgnP59242 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CgnP59242 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CgnP59242 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CgnP59242 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CgnP59242 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CgnP59242 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CgnP59242 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CgnP59242 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CgnP59242 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CgnP59242 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CgnP59242 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CgnP59242 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CgnP59242 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CgnP59242 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CgnP59242 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CgnP59242 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CgnP59242 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CgnP59242 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CgnP59242 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CgnP59242 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CgnP59242 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CgnP59242 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CgnP59242 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CgnP59242 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CgnP59242 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CgnP59242 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CgnP59242 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CgnP59242 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CgnP59242 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CgnP59242 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CgnP59242 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CgnP59242 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CgnP59242 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CgnP59242 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CgnP59242 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CgnP59242 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CgnP59242 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CgnP59242 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CgnP59242 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CgnP59242 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CgnP59242 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CgnP59242 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CgnP59242 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CgnP59242 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CgnP59242 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CgnP59242 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CgnP59242 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CgnP59242 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CgnP59242 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CgnP59242 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CgnP59242 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CgnP59242 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CgnP59242 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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