Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Paxbp1P58501 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms