Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Setd4P58467 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Setd4P58467 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Setd4P58467 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd4P58467 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd4P58467 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd4P58467 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd4P58467 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd4P58467 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd4P58467 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd4P58467 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd4P58467 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd4P58467 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd4P58467 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Setd4P58467 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Setd4P58467 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Setd4P58467 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd4P58467 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Setd4P58467 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms