Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NcstnP57716 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NcstnP57716 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NcstnP57716 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NcstnP57716 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NcstnP57716 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NcstnP57716 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms