Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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