Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace1P56818 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace1P56818 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace1P56818 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace1P56818 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace1P56818 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bace1P56818 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Bace1P56818 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms