Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AgrpP56473 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AgrpP56473 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AgrpP56473 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AgrpP56473 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AgrpP56473 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AgrpP56473 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AgrpP56473 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms