Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CdaP56389 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CdaP56389 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CdaP56389 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CdaP56389 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CdaP56389 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CdaP56389 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CdaP56389 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CdaP56389 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CdaP56389 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CdaP56389 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CdaP56389 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CdaP56389 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CdaP56389 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CdaP56389 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CdaP56389 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CdaP56389 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CdaP56389 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CdaP56389 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CdaP56389 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CdaP56389 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CdaP56389 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CdaP56389 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CdaP56389 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CdaP56389 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CdaP56389 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CdaP56389 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CdaP56389 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CdaP56389 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CdaP56389 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CdaP56389 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CdaP56389 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CdaP56389 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CdaP56389 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CdaP56389 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CdaP56389 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CdaP56389 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CdaP56389 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CdaP56389 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CdaP56389 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CdaP56389 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CdaP56389 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CdaP56389 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CdaP56389 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CdaP56389 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CdaP56389 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CdaP56389 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CdaP56389 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CdaP56389 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CdaP56389 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CdaP56389 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms