Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GferP56213 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GferP56213 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GferP56213 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GferP56213 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GferP56213 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GferP56213 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GferP56213 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GferP56213 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GferP56213 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GferP56213 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GferP56213 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GferP56213 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GferP56213 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GferP56213 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GferP56213 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GferP56213 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GferP56213 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GferP56213 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GferP56213 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GferP56213 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GferP56213 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GferP56213 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GferP56213 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GferP56213 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GferP56213 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GferP56213 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GferP56213 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GferP56213 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GferP56213 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GferP56213 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GferP56213 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GferP56213 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GferP56213 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms