Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PltpP55065 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PltpP55065 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PltpP55065 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PltpP55065 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PltpP55065 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PltpP55065 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PltpP55065 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PltpP55065 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PltpP55065 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PltpP55065 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PltpP55065 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PltpP55065 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PltpP55065 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PltpP55065 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PltpP55065 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PltpP55065 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PltpP55065 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PltpP55065 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PltpP55065 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PltpP55065 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PltpP55065 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PltpP55065 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PltpP55065 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PltpP55065 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PltpP55065 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PltpP55065 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PltpP55065 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PltpP55065 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PltpP55065 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PltpP55065 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PltpP55065 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PltpP55065 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PltpP55065 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PltpP55065 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PltpP55065 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PltpP55065 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PltpP55065 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PltpP55065 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PltpP55065 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PltpP55065 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PltpP55065 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PltpP55065 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PltpP55065 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PltpP55065 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PltpP55065 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PltpP55065 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PltpP55065 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PltpP55065 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PltpP55065 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PltpP55065 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PltpP55065 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PltpP55065 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PltpP55065 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PltpP55065 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PltpP55065 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PltpP55065 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PltpP55065 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PltpP55065 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PltpP55065 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PltpP55065 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PltpP55065 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PltpP55065 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PltpP55065 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PltpP55065 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PltpP55065 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PltpP55065 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PltpP55065 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PltpP55065 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PltpP55065 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PltpP55065 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PltpP55065 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PltpP55065 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PltpP55065 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PltpP55065 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PltpP55065 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PltpP55065 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PltpP55065 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PltpP55065 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PltpP55065 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PltpP55065 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PltpP55065 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms