Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23bP54728 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms