Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rad23aP54726 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms