Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacnb3P54285 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacnb3P54285 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms