Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PitpnbP53811 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PitpnbP53811 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms