Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Map3k1P53349 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Map3k1P53349 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms