Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna1P52793 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna1P52793 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna1P52793 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna1P52793 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna1P52793 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna1P52793 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna1P52793 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efna1P52793 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms