Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Fgd1P52734 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd1P52734 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms