Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apobec1P51908 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apobec1P51908 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms