Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CntfP51642 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CntfP51642 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CntfP51642 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CntfP51642 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CntfP51642 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfP51642 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfP51642 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfP51642 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfP51642 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfP51642 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfP51642 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfP51642 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfP51642 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfP51642 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfP51642 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfP51642 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfP51642 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CntfP51642 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfP51642 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfP51642 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfP51642 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfP51642 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfP51642 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfP51642 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfP51642 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfP51642 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfP51642 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfP51642 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfP51642 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfP51642 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfP51642 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfP51642 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfP51642 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfP51642 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CntfP51642 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfP51642 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfP51642 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfP51642 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfP51642 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfP51642 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfP51642 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfP51642 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfP51642 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfP51642 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfP51642 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfP51642 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfP51642 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfP51642 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CntfP51642 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfP51642 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfP51642 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfP51642 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfP51642 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfP51642 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfP51642 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfP51642 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfP51642 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfP51642 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfP51642 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfP51642 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfP51642 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfP51642 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfP51642 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfP51642 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CntfP51642 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfP51642 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfP51642 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfP51642 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfP51642 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfP51642 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfP51642 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfP51642 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfP51642 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfP51642 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfP51642 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfP51642 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfP51642 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfP51642 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfP51642 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfP51642 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfP51642 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CntfP51642 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfP51642 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfP51642 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfP51642 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfP51642 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfP51642 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfP51642 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfP51642 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfP51642 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfP51642 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfP51642 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfP51642 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfP51642 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfP51642 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfP51642 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfP51642 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfP51642 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CntfP51642 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms