Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XpcP51612 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XpcP51612 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XpcP51612 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XpcP51612 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XpcP51612 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XpcP51612 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XpcP51612 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XpcP51612 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XpcP51612 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XpcP51612 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XpcP51612 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XpcP51612 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XpcP51612 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XpcP51612 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XpcP51612 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XpcP51612 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XpcP51612 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XpcP51612 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XpcP51612 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XpcP51612 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XpcP51612 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XpcP51612 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XpcP51612 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XpcP51612 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XpcP51612 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XpcP51612 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XpcP51612 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XpcP51612 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XpcP51612 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XpcP51612 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XpcP51612 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XpcP51612 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XpcP51612 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XpcP51612 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XpcP51612 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XpcP51612 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XpcP51612 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XpcP51612 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XpcP51612 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XpcP51612 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XpcP51612 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XpcP51612 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XpcP51612 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XpcP51612 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XpcP51612 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XpcP51612 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XpcP51612 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XpcP51612 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XpcP51612 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XpcP51612 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XpcP51612 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XpcP51612 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XpcP51612 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XpcP51612 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XpcP51612 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XpcP51612 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XpcP51612 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XpcP51612 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XpcP51612 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XpcP51612 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XpcP51612 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XpcP51612 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XpcP51612 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XpcP51612 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XpcP51612 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XpcP51612 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XpcP51612 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XpcP51612 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XpcP51612 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XpcP51612 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XpcP51612 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XpcP51612 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XpcP51612 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XpcP51612 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XpcP51612 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XpcP51612 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XpcP51612 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XpcP51612 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XpcP51612 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XpcP51612 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XpcP51612 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XpcP51612 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XpcP51612 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XpcP51612 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XpcP51612 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XpcP51612 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XpcP51612 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XpcP51612 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XpcP51612 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XpcP51612 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XpcP51612 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XpcP51612 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XpcP51612 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XpcP51612 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XpcP51612 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XpcP51612 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XpcP51612 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XpcP51612 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XpcP51612 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms