Protein–RNA interactions for Protein: P50571

Gabrb1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb1P50571 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrb1P50571 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms