Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5P49615 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5P49615 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms