Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GdnfP48540 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GdnfP48540 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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GdnfP48540 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GdnfP48540 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GdnfP48540 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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GdnfP48540 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GdnfP48540 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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GdnfP48540 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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GdnfP48540 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GdnfP48540 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GdnfP48540 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GdnfP48540 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GdnfP48540 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms