Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rfx2P48379 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rfx2P48379 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms