Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn3P48299 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn3P48299 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn3P48299 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn3P48299 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn3P48299 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn3P48299 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn3P48299 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms