Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TgfaP48030 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TgfaP48030 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TgfaP48030 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TgfaP48030 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TgfaP48030 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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