Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl5P47962 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms