Protein–RNA interactions for Protein: P47915

Rpl29, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl29P47915 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms