Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax9P47242 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax9P47242 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax9P47242 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax9P47242 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax9P47242 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax9P47242 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax9P47242 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax9P47242 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax9P47242 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms