Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn1bP46414 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms