Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf4P43488 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf4P43488 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms