Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlx1P43345 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlx1P43345 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms