Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LifrP42703 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LifrP42703 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LifrP42703 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LifrP42703 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LifrP42703 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LifrP42703 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LifrP42703 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LifrP42703 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LifrP42703 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LifrP42703 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LifrP42703 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LifrP42703 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LifrP42703 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LifrP42703 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LifrP42703 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LifrP42703 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LifrP42703 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LifrP42703 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LifrP42703 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LifrP42703 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LifrP42703 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LifrP42703 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LifrP42703 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LifrP42703 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LifrP42703 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LifrP42703 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LifrP42703 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LifrP42703 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LifrP42703 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LifrP42703 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LifrP42703 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LifrP42703 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LifrP42703 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LifrP42703 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LifrP42703 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LifrP42703 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LifrP42703 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LifrP42703 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LifrP42703 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LifrP42703 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LifrP42703 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LifrP42703 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LifrP42703 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LifrP42703 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LifrP42703 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LifrP42703 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LifrP42703 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LifrP42703 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LifrP42703 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LifrP42703 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LifrP42703 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LifrP42703 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LifrP42703 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LifrP42703 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LifrP42703 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LifrP42703 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LifrP42703 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LifrP42703 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LifrP42703 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LifrP42703 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LifrP42703 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LifrP42703 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LifrP42703 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LifrP42703 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LifrP42703 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LifrP42703 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LifrP42703 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LifrP42703 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LifrP42703 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LifrP42703 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LifrP42703 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LifrP42703 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LifrP42703 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LifrP42703 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LifrP42703 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LifrP42703 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LifrP42703 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LifrP42703 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LifrP42703 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LifrP42703 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LifrP42703 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LifrP42703 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LifrP42703 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LifrP42703 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LifrP42703 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LifrP42703 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LifrP42703 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LifrP42703 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LifrP42703 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LifrP42703 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LifrP42703 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LifrP42703 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LifrP42703 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LifrP42703 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LifrP42703 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LifrP42703 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LifrP42703 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LifrP42703 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LifrP42703 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms