Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx1-2P42580 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms