Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tac1P41539 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tac1P41539 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tac1P41539 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tac1P41539 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tac1P41539 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tac1P41539 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tac1P41539 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms