Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd9P40240 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd9P40240 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd9P40240 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd9P40240 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd9P40240 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd9P40240 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd9P40240 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd9P40240 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd9P40240 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd9P40240 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd9P40240 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd9P40240 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd9P40240 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd9P40240 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd9P40240 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd9P40240 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms