Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ThpoP40226 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ThpoP40226 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ThpoP40226 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ThpoP40226 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ThpoP40226 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ThpoP40226 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ThpoP40226 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ThpoP40226 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ThpoP40226 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ThpoP40226 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ThpoP40226 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ThpoP40226 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms