Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf2P39429 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf2P39429 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf2P39429 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf2P39429 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf2P39429 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf2P39429 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms