Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtlP38585 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtlP38585 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtlP38585 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtlP38585 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtlP38585 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtlP38585 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtlP38585 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtlP38585 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtlP38585 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtlP38585 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtlP38585 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtlP38585 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TtlP38585 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TtlP38585 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TtlP38585 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TtlP38585 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtlP38585 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtlP38585 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtlP38585 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtlP38585 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TtlP38585 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtlP38585 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtlP38585 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtlP38585 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtlP38585 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtlP38585 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtlP38585 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtlP38585 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtlP38585 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtlP38585 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtlP38585 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtlP38585 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtlP38585 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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