Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PtprkP35822 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprkP35822 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PtprkP35822 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtprkP35822 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PtprkP35822 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PtprkP35822 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PtprkP35822 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms