Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab20P35295 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab20P35295 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab20P35295 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab20P35295 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab20P35295 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab20P35295 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms