Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab23P35288 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab23P35288 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab23P35288 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab23P35288 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab23P35288 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab23P35288 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab23P35288 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab23P35288 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab23P35288 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab23P35288 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms