Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms