Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp4P35123 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp4P35123 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp4P35123 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp4P35123 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp4P35123 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp4P35123 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms