Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mmp12P34960 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp12P34960 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms