Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms